ניתוח הסרת משקפיים בלייזר מורכב משני שלבים: בשלב הראשון הרופא פותח חלון טיפולי בקרנית, ובשלב השני הלייזר מעצב מחדש את פני הקרנית על פי נתוני העיניים של המטופל. לאחר מכן הרופא סוגר את החלון הטיפולי. ישנן מספר אפשרויות לניתוח הסרת משקפיים בלייזר המותאמים לצרכיו של כל מטופל: הסרת משקפיים בלייזר והסרת משקפי קריאה בניתוחי קטרקט, בהשתלת קרנית, בהשתלת עדשה, בטיפול בקרטוקונוס, בטיפול בעין עצלה, בטיפולי רשתית ועוד.